海都宗主权下的察合台汗国
公元1264年，八剌虽然在与忽必烈的战争中占到了便宜，可是在和窝阔台家族首领海都的战争中，却遭受惨败。双方交战的原因是八剌拒绝承认海都的宗主权。
起初，八剌在阿姆河附近的战斗中击败了海都，俘获了许多土兵和战利品。可是，随着海都援军﹣钦察汗忙哥帖木儿五万军队的到来，寡不敌众的八剌节节败退。
在被钦察将军别儿克贾击溃后，他只好退入河中地区。就在他准备用不花剌和撒马尔罕的财力重新武装军队，与海都殊死一搏时，急着要去攻打忽必烈的海都向他提出了议和，条件是让他继续当河中地区的主人。
最后，八剌把伊犁河地区和东突厥斯坦交给海都控制作为回报，并承认了海都的宗主权。为此，他们还于1267年召开了一次调解性的库里勒台（库里勒台是选举大汗的一种会议形式）。
为了把八剌调离东突厥斯坦，海都派他去攻打阿八哈汗，以夺取波斯汗国。八剌通过向不花剌和撒马尔罕征收沉重税赋充当军饷，率领着由成吉思汗系宗王为全军支柱的军队向阿富汗地区进发。战争初期战事较为顺利，他们在赫拉特将呼罗珊长官、阿八哈汗的兄弟布金击败，顺势占领了呼罗珊大部分地区，还顺手牵羊洗劫了尼沙普尔，赫拉特的穆罕默德向八剌称臣纳贡。
从阿塞拜疆匆忙赶回的阿八哈汗在赫拉特附近设伏。1270年7月22日，贸然进军的八剌遭到了毁灭性的打击。随后，八剌带着残兵败将退回河中，他的腿因在途中从马上摔下来而变跛。
他在不花剌度过了整个冬天，并开始皈依了伊斯兰教。
失败的八剌同时也失去了亲属和属臣们的支持，无奈之下，他只好向宗主海都求援。海都率两万兵马赶到战场，但海都不是去救援他，而是趁火打劫。遭此变故的八剌在1271年8月9号忧愤而死。
八剌死后，他的四个儿子和阿鲁忽的两个儿子为了河中的独立，联合起来对付海都的军队。虽然他们有机会占领河中诸城，但最终还是被海都各个击破。1271年，海都任命另一个察合台宗王捏古伯为察合台汗。
但是，捏古伯最后也因企图摆脱海都控制，实现自治而被海都处死。
1274年，海都又立另一位察合台宗王、不里之孙秃花帖木儿为察合台汗。然而，秃花帖木儿在继位不到一年就去世了，因此，由八剌之子都哇继承汗位。
为报八剌的入侵之仇，波斯汗阿八哈于1272年年底派军进攻花剌子模和河中，在洗劫了乌尔根奇和希瓦后又入侵不花剌。在不花剌，阿八哈的军队烧杀抢掠持续了一周之久，那些未能逃走的居民以十人抽杀一人的方式被屠杀，剩下的五万俘虏被带回波斯。
侵略者走后，麻速忽又一次在他的河中废墟里开始了重建工作。他致力于这一项工作，直到1289年冬季去世。之后，他的三个儿子阿弗•别克儿、萨替尔密什•伯克和苏英尼奇继续他的工作，依次管理不花剌和撒马尔罕。但是，他们都和察合台的后裔划清了界限，选择依靠可怕的海都。
都哇吸取前几任察合台汗的教训，一直忠诚地追随海都。1275年，都哇和海都联手攻打支持忽必烈的畏兀儿地区都护，企图使其归顺。就在他们向其都城别失八里进军时，忽必烈的军队有如天神降临，将二人的如意算盘打了破碎。
1301年，都哇帮助海都打忽必烈之孙铁穆耳，并俘获和处死了铁穆耳的女婿、汪古部的阔里吉思。之后， 都哇准备举兵进犯吐鲁番和甘肃的元朝边界，却反遭元兵的袭击，其军队作鸟兽
散。1301年，海都和都哇在哈拉和林被铁穆耳的军队击败，海都在撤退途中身亡。
海都是蒙古历史上昙花一现的人物，有强烈的个性，具有君主的才能。他为河中的城市文明和农民利益而采取的英明举措，彰显出他的眼光远远超越了传统的游牧民族对城市及农耕的认知。他所发动的41次战争，证明他是一位军事指挥的天才。
他是当时唯一可以和忽必列抗衡的人，忽必烈始终没能战胜他。他之所以没有成功，是因为他生不逢时。因为当时忽必烈已经在中国牢固地建立起国家，成吉思汗的各支也已经或半中国化、或半突厥化，或半波斯化了。他想要再把那些原始的东西强加于人是不现实的。
